抵押贷款的房证在以下情况下可能会被留存在贷款机构处：

1. 贷款未还清：如果借款人尚未还清贷款，房证通常会被留存在贷款机构处，以确保借款人继续履行还款义务。
2. 抵押登记手续未完成：在抵押贷款过程中，需要进行抵押登记手续，将抵押权人（贷款机构）登记为房屋的抵押权人。如果登记手续未完成，房证可能会被留存在贷款机构处。
3. 贷款机构要求留存：一些贷款机构可能会要求留存抵押贷款的房证，以保障借款人的还款能力。
4. 法律规定需要留存：在一些国家和地区，法律可能规定在特定情况下需要将房证留存在贷款机构处，以确保抵押品的真实性和合法性。

需要注意的是，不同地区和不同贷款机构的具体流程和要求可能会有所不同。因此，具体情况需要咨询当地银行或贷款机构的工作人员。